灵芝是一种宝贵的药食菌,其孢子是其生命的重要阶段。灵芝孢子通常为棕色或深褐色,形状为球形或卵形。孢子营养丰富,含有多种有益物质,如多糖、三萜和蛋白质等。灵芝孢子有极强的耐热、耐干和耐腐败性,可以在各种环境下存活,从而保证了它们成为灵芝菌丝生长的种子。
在恰当的环境下(温度、湿度等条件适宜),灵芝孢子会开始发芽。一旦孢子开始发芽,从孢子内部中心开始形成一股菌丝,是为初生菌丝,这些菌丝会呈分叉生长。当初生菌丝初次形成交叉点后,交叉点发生了细胞核的交换,在第一个布谷鸟菌丝体内就会形成两个不同的互生子实体。这时,互生子实会在成熟的\菌田种植基质中形成一系列分枝,再分枝,直到形成小菌丝体系,接下来的每个新菌根据菌核的细胞分裂,不断繁殖,逐渐长成生长旺盛且内部结构良好的菌丝。
在菌丝的合并过程中,菌丝细胞核中的细胞质会相融合,在此过程中,由于细胞在结合过程中产生竞争,细胞质会出现一种掣肘现象,此时,小菌幼苗就开始分化了。原始小菌丝体系不断分化和组合成更复杂的真菌体系。这个过程非常复杂,一些细胞会发育成为纤维状或管状的生殖器官,生殖器官内部的孢子不断产生并且繁殖,进而形成更复杂的真菌体系。新萌发的细胞形成的菌株将会不断地群聚和铺张,终形成一个完整的灵芝菌丝体系。

在适应的环境中,灵芝孢子可以迅速地长成完整的灵芝菌丝系统,这是与其他菌类的繁殖过程极其相似的。随着环境的不断变化,灵芝菌丝的形态和身体功能也会逐渐发生变化,以适应当地的环境,使其生命的新的阶段不断地继续。